在鲁鲁修总集篇第一章兴道中，枪击维蕾塔的人从夏莉变成了迪特哈尔特，夏莉在第一章是是成功的躲过了自己的杯具开端，而在今天上映的鲁鲁修总集篇第二章叛道中，关于夏莉的剧情又有重要修改，在叛道中夏莉没有被罗洛杀死，夏莉成为了目前为止总集篇版中最大的赢家，自己的悲剧看上去全都躲开了。
第二章的剧情变动有：
神根岛漂流剧情消失
朱雀和尤菲的剧情大体上保留，而鲁鲁修和尤菲的剧情大幅削减
尤菲帮助妮娜的剧情消失，但是妮娜还是喜欢尤菲
第一章中枪击维蕾塔的人从夏莉变成了迪特哈尔特，夏莉在总集篇中就没有接触到过于自己父亲的事情，被鲁鲁修使用 Geass 消除记忆的理由不存在了
毛在没有剧情铺垫的情况下 Geass 能力突然暴走
妮娜引爆盖尼米得的 Flag 消失
因为毛的剧情没有，所以朱雀和鲁鲁修两人部分剧情也消失
在黑色叛乱的最后追加了卡莲与皇神乐耶流泪的画面
没有鲁鲁修记忆复活的剧情
没有罗洛笼络剧情
朱雀没来学校，因为没有朱雀相会所以也就没有娜娜莉打来的电话与百万的奇迹剧情
没有中华联邦战争剧情
成为俘虏的卡莲与娜娜莉对话，朱雀也不在
夏莉确信鲁鲁修是 Zero 没有怀疑与厌恶很顺利的就接受了这个事实
杰瑞米亚劝了夏莉不要过度的涉入危险的事情中
总集篇第二章中罗洛没杀夏莉（严谨点来说是没有出现这个关键的剧情）
在夏莉存活的情况下 GEASS向团被歼灭
第二章是截止到 R2 的第 16 话，第三章就要看看这个剧情修改了很多后的总集篇要安排什么样的零之镇魂曲计划，能够与未来的续作联系起来。